一、内镜室设病人候诊区、诊疗室、清洗消毒室、内镜储藏室。清洗消毒室应保持良好的通风，诊疗室设空气消毒机，确保室内空气清洁。
二、保持各区的清洁。诊疗室、清洗消毒室操作结束后严格进行终末消毒。
三、从事内镜诊疗时，医护人员应戴好口罩和帽子，防止呼吸道疾病的感染。在内镜清洗消毒时，应当具备内镜清洗消毒方面的知识，接受相关的医院感染知识培训，严格遵守有关规章制度。
四、工作人员清洗和消毒内镜时，应穿戴必要的防护用品，包括工作服、防渗透围裙、口罩、帽子、手套等。 五、内镜的消毒须用2％戊二醛消毒浸泡30分钟，消毒后用无菌蒸馏水充分冲洗；进入无菌组织器官的内镜如胸腔镜、腹腔镜、活检钳必须在2％戊二醛浸泡10小时方可使用。鼓励采用低温灭菌。
六、每日诊疗工作开始前，必须对当日拟使用的消毒内镜进行再次消毒，消毒时间不少于20分钟，冲洗、干燥后，方可用于病人诊疗。
七、使用后的内镜及附件应按照《内窥镜清洗消毒技术操作规范》的有关规范要求进行消毒或灭菌。禁止使用非流动水对内镜进行清洗。内镜及附件的清洗、消毒或者灭菌时间应当使用计时器控制。

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八、使用后的内镜采用2%碱性戊二醛消毒，浸泡时间不少于20分钟；HBsAg阳性病人和结核杆菌、其它分枝杆菌等特殊感染患者使用后的内镜浸泡时间不少于45分钟。当日不再继续使用的内镜采用2%碱性戊二醛浸泡消毒30分钟。采用2%碱性戊二醛灭菌的内镜及附件，灭菌需浸泡10小时以上。
九、消毒后的内镜，储存前先干燥处理，再悬挂保存于无菌柜内。储柜内表面应光滑、无缝隙、便于清洗，每周清洗消毒一次。
十、一次性接口、弯盘做到一人一用，用后送焚烧炉焚烧；抽吸管一次性使用；吸引器每次用后用消毒液浸泡消毒后清洗备用。
十一、无菌镊、棉球罐、纱布罐、治疗碗、弯盘及器械每周高压蒸气灭菌二次。气管镜室应当作好内镜清洗消毒的登记工作。
十二、每日监测使用中的消毒剂的有效浓度，记录保存，低于有效浓度应立即更换。消毒剂使用的时间不得超过产品说明规定的使用期限。
十三、治疗床上的床单、枕套，随脏随换。如检查过乙肝表面抗原阳性患者或被呕吐物、分泌物污染时必须及时更换。

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